0512-8957 3668 / 18013764755
文獻(xiàn)推薦 | CRISPR/Cas9技術(shù)敲除斑馬魚rpl15基因?qū)Π唏R魚紅系造血發(fā)育的影響
來源:http://dx.doi.org/10.16016/j.1000-5404.202010180 | 作者:木芮生物 | 發(fā)布時(shí)間: 2023-10-23 | 263 次瀏覽 | 分享到:
[摘要] 目的 利用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除斑馬魚rpl15基因,探討rpl15基因?qū)Π唏R魚紅系造血發(fā)育的影響戏锹。方法 針對斑馬魚rpl15基因設(shè)計(jì)并制備gRNA(guide RNA)隶症,將gRNA與Cas9蛋白的混合物顯微注射到單細(xì)胞期斑馬魚受精卵中枕磁,提取72 h胚胎基因組DNA,PCR擴(kuò)增出目的片段碱璃,T7E1限制性酶切法檢測基因打靶情況,隨后進(jìn)行測序分析確定編輯效果饭入。通過O-dianisidine染色分析血紅蛋白合成情況嵌器,中性粒細(xì)胞染色分析中性粒細(xì)胞生成情況,利用Real-time PCR檢測p53谐丢、mdm2爽航、hsp70和造血相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá)變化。結(jié)果 成功制備了rpl15 gRNA, 并篩選得到rpl15突變體乾忱。rpl15基因敲除的幼魚出現(xiàn)體長縮短讥珍、尾部彎曲、頭部和眼睛較小及心包水腫的表型窄瘟;造血相關(guān)譜系染色結(jié)果顯示rpl15突變體血紅蛋白合成明顯減少衷佃,但中性粒細(xì)胞生成未受影響;rpl15突變體p 53和mdm2的mRNA表達(dá)均顯著升高(P < 0.01蹄葱,P < 0.05, )纲酗,α-globin、gata1和hsp70的mRNA表達(dá)均顯著下調(diào)(P < 0.01新蟆,P < 0.05觅赊,P < 0.05),除紅系外的造血相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的mRNA表達(dá)與對照組相比均無明顯差異琼稻。結(jié)論 利用CRISPR/Cas9技術(shù)成功編輯了斑馬魚rpl15基因吮螺,突變體產(chǎn)生了類似先天性純紅細(xì)胞再生障礙性貧血疾病的表型。同時(shí)表明p53與hsp70可能參與調(diào)控突變體表型的形成。


彭濤1,2, 周唯君1,2, 劉含1,2, 趙硯馳1,2, 李化1,2, 張鵬1,2, 周艷華1,2, 舒莉萍1,2

1. 550004 貴陽鸠补,貴州醫(yī)科大學(xué)細(xì)胞工程生物醫(yī)藥技術(shù)國家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室萝风,基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)教研室,貴州省再生醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
2. 550004 貴陽紫岩,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院成體干細(xì)胞轉(zhuǎn)化研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
收稿: 2020-10-27规惰;修回: 2021-01-04
基金項(xiàng)目: 國家自然科學(xué)基金地區(qū)科學(xué)基金項(xiàng)目(31860325);貴州省科技計(jì)劃項(xiàng)目(黔科合基礎(chǔ)【2020】IY092)
通信作者: 舒莉萍泉蝌,E-mail:gyslp456@gmc.edu.cn


[關(guān)鍵詞] CRISPR/Cas9    rpl15基因    DBA    斑馬魚


Effects of rpl15 gene knockout by CRISPR/Cas9 on zebrafish erythroid hematopoietic development

PENG Tao1,2, ZHOU Weijun1,2, LIU Han1,2, ZHAO Yanchi1,2, LI Hua1,2, ZHANG Peng1,2, ZHOU Yanhua1,2, SHU Liping1,2

1. National&Guizhou Joint Engineering Laboratory for Cell Engineering and Biomedicine Technique, Guizhou Provincial Key Laboratory of Regenerative Medicine, Department of Immunology, School of Basic Medicine, Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou Province, 550004;
2. Key Laboratory of Adult Stem Cell Translational Research, Chinese Academy of Medical Sciences, Guiyang, Guizhou Province, 550004, China
Supported by the Regional Program of National Natural Science Foundation of China (31860325) and the Project of Science and Technology Plan of Guizhou Province (2020-IY092)
Corresponding author: SHU Liping, E-mail: gyslp456@gmc.edu.cn.


[Abstract] Objective To determine the effect of knocking out zebrafish rpl15 gene by CRISPR/Cas9 editing technique on zebrafish erythroid hematopoietic development. Methods Guide RNA was designed and prepared for rpl15 gene of zebrafish and the mixture of gRNA and Cas9 protein was microinjected into zebrafish zygote at single cell stage. Genomic DNA was extracted after 72 h and the target fragment was amplified by PCR. Editing effect was evaluated by T7E1 restriction enzyme digestion of the PCR products followed by DNA sequencing. Hemoglobin synthesis was analyzed by O-dianisidine staining, neutrophil production was analyzed by neutrophil staining, and the expression of p53, mdm2, hsp70 and hematopoiesis related transcription factor genes was detected by real-time PCR. Results The rpl15 gRNA was successfully prepared and the rpl15 mutants were selected. The results showed that zebrafish rpl15 gene knockout juveniles showed a phenotype of shortened body length, curved tail, smaller head and eyes, and pericardial edema. Hematopoietic lineage staining showed that hemoglobin synthesis in rpl15 mutant was significantly decreased, but neutrophil production was not affected. The mRNA expression levels of rpl15 mutant p53 and mdm2 were significantly increased (P < 0.01, P < 0.05), while those of α-globin, gata 1 and hsp70 were obviously down-regulated (P < 0.01, P < 0.05, P < 0.05). There were no significant differences between the rpl15 mutant and the control group in the mRNA expression levels of hematopoiesis-related transcription factors except erythroid-related ones. Conclusion The rpl15 gene of zebrafish is successfully edited by CRISPR/Cas9 technique, and the mutant produces a phenotype similar to Diamoncl-Blackfan anemia disease. At the same time, it is suggested that p53 and hsp70 may be involved in regulating the formation of mutant phenotype.


[Key words] CRISPR/Cas9    rpl15 gene    DBA    zebrafish


核糖體蛋白L15(ribosomal protein L15歇万,RPL15)屬于真核生物核糖體60S亞基的一個(gè)組成部分,分布于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)勋陪,主要定位于核仁并呈點(diǎn)狀分布贪磺。RPL15在核仁中的定位有利于核仁結(jié)構(gòu)的形成與維持,也可能參與rRNA的成熟過程[1]诅愚。核糖體蛋白除了主要參與蛋白質(zhì)合成過程外寒锚,也可通過參與復(fù)制、轉(zhuǎn)錄违孝、RNA加工刹前、DNA修復(fù)等過程在細(xì)胞增殖、凋亡雌桑、發(fā)育的調(diào)控和惡性轉(zhuǎn)化等方面發(fā)揮作用腮郊。RPL15與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展具有相關(guān)性。研究表明筹燕,RPL15在胃癌轧飞、食管癌、結(jié)腸癌中過度表達(dá)[2]撒踪,與此相反过咬,在皮膚鱗狀細(xì)胞癌和胰腺導(dǎo)管腺癌中表達(dá)卻下調(diào)[3]。極光激酶抑制劑Danusertib可通過負(fù)性調(diào)控RPL15這個(gè)下游關(guān)鍵靶位點(diǎn)制妄,引起具有紅系分化潛能的K562細(xì)胞發(fā)生程序性死亡[4]掸绞。與此同時(shí),研究表明RPL15基因被證實(shí)在先天性純紅細(xì)胞再生障礙性貧血(Diamoncl-Blackfan anemia耕捞,DBA)患者中存在突變[5]衔掸。但目前RPL15基因在紅系造血發(fā)育疾病發(fā)生發(fā)展中的機(jī)制尚未闡述清晰,進(jìn)一步深入認(rèn)識RPL15基因?qū)t系造血發(fā)育的作用機(jī)制具有重要意義俺抽。通過比較發(fā)現(xiàn)人與斑馬魚Rpl15蛋白有79%的同源性敞映,更重要的是斑馬魚體外受精、體外發(fā)育磷斧、胚胎透明及產(chǎn)卵量大等優(yōu)勢振愿,使其成為研究疾病發(fā)生發(fā)展的良好模式生物捷犹。近幾年CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)因其系統(tǒng)設(shè)計(jì)簡單、成本低廉冕末、快捷高效等優(yōu)點(diǎn)萍歉,在斑馬魚基因編輯領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用[6-7]。因此档桃,本研究選擇斑馬魚為研究對象枪孩,利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)對rpl15基因進(jìn)行敲除,通過測序篩選陽性突變體藻肄,觀察敲除rpl15斑馬魚的表型變化蔑舞,初步探討了敲除rpl15對斑馬魚紅系造血發(fā)育的影響,為研究rpl15在紅系造血疾病發(fā)生發(fā)展中的作用提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)仅炊。


1 材料與方法1.1 材料

1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

Tubingen(本課題組飼養(yǎng))品系野生型斑馬魚斗幼,飼養(yǎng)于28.5 ℃恒溫自動(dòng)循環(huán)水系統(tǒng)中澎蛛,光暗周期比為12 h ∶12 h抚垄。取雌雄斑馬魚按1 ∶(1~2) 的比例放入產(chǎn)卵缸內(nèi),用隔板分隔開谋逻,次日光照10 min后拔板呆馁,0.5 h后收集受精卵,胚胎置于28.5 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)毁兆。


1.1.2 試劑

質(zhì)粒pSP6-2sNLS-spCas9由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院上海血液病研究所袁浩博士惠贈(zèng)浙滤;轉(zhuǎn)錄試劑盒(MEGAshortscript T7 Transcription kit)、mRNA純化試劑盒(mirVanaTM miRNA isolation kit)气堕、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(RevertAidTM First Strand cDNA Synthesis Kit)和Cas9蛋白(TrueCutTM Cas9 Protein v2)試劑盒均購自美國Thermo Fisher Scientific公司纺腊;T7E1限制性內(nèi)切酶購自New England Biolabs(NEB)公司;PCR引物茎芭、DNA序列及DNA Marker購自Invitrogen公司揖膜;PCR試劑盒和普通DNA產(chǎn)物純化試劑盒購自天根生化科技有限公司;斑馬魚血紅蛋白O-dianisidine染色試劑盒梅桩、斑馬魚中性粒細(xì)胞染色試劑盒購自蘇州木芮生物科技有限公司壹粟。


1.1.3 儀器

超微量分光光度計(jì)(NanoDrop one)購自Thermo Fisher Scientific公司;顯微注射儀(PLI-100)購自Harvard Apparatus公司宿百;Real-time PCR儀(C1000)購自Bio-Rad公司趁仙;體式顯微鏡(SMZ645)購自Nikon公司。


1.2 斑馬魚rpl15基因敲除

1.2.1 gRNA靶位點(diǎn)及鑒定引物設(shè)計(jì)

根據(jù)靶位點(diǎn)預(yù)測網(wǎng)站http://crispr.dbcls.jp/預(yù)測符合設(shè)計(jì)條件的rpl15基因的gRNA垦页。隨后通過靶位點(diǎn)評估網(wǎng)站http://www.oligoevaluator.com/什猖,在斑馬魚rpl15第一外顯子和第三外顯子處選取5個(gè)沒有脫靶且高效的靶位點(diǎn)(表 1)。同時(shí)設(shè)計(jì)各靶序列的鑒定引物另患。


表 1 rpl15 gRNA靶位點(diǎn)核苷酸序列

靶位點(diǎn)序列(5′→3′)位置
gRNA1GGCCTTGTATCCCAGTCTACGGG1號外顯子上
gRNA2GGGAGCGTACAAGTATATGCAGG1號外顯子上
gRNA3ACCAGATAAAGCCCGTAGACTGG1號外顯子上
gRNA4CCAGATAAAGCCCGTAGACTGGG1號外顯子上
gRNA5GGTCCTGAACTCCTACTGGGTGG3號外顯子上
_:PAM序列


1.2.2 gRNA的制備

采用PCR產(chǎn)物體外轉(zhuǎn)錄的方法合成gRNA犀斋。具體方法如下:在選取的靶位點(diǎn)序列前方添加T7啟動(dòng)子序列5′-TAATACGACTCACTATA-3′及識別堿基G律胀,后方添加部分骨架序列5′-GTTTTAGAGCTAGAAATAGC-3′,然后以上述合成pT7-gRNAn (n=1貌矿、2炭菌、3、4逛漫、5) DNA片段作為正向引物(表 2)黑低,反向引物為gRNA骨架通用引物PRgRNA:5′-AAAAAAAGCACCGACTCGGT-3′。以pSP6-2sNLS-spCas9質(zhì)粒作為模板酌毡,通過PCR擴(kuò)增出轉(zhuǎn)錄所需DNA片段克握,PCR反應(yīng)條件為94 ℃,3 min; 30×(94 ℃枷踏,30 s菩暗;60 ℃,30 s旭蠕;72 ℃停团,1 min);72 ℃掏熬,5 min佑稠,4 ℃保存。通過瓊脂糖凝膠電泳及測序檢測PCR產(chǎn)物是否正確旗芬,將測序結(jié)果正確的PCR產(chǎn)物經(jīng)純化回收后舌胶,用T7轉(zhuǎn)錄試劑盒體外轉(zhuǎn)錄gRNA。純化回收轉(zhuǎn)錄的gRNA并進(jìn)行濃度測定疮丛,gRNA原液分裝凍存于-80 ℃幔嫂。


表 2 制備gRNA體外轉(zhuǎn)錄模板正向引物序列

靶位點(diǎn)序列(5′→3′)
gRNA1TAATACGACTCACTATAGGGCCTTGTATCCCAGTCTACGTTTTAGAGCTAG
gRNA2TAATACGACTCACTATAGGGGAGCGTACAAGTATATGCGTTTTAGAGCTAG
gRNA3TAATACGACTCACTATAGACCAGATAAAGCCCGTAGACGTTTTAGAGCTAG
gRNA4TAATACGACTCACTATAGCCAGATAAAGCCCGTAGACTGTTTTAGAGCTAG
gRNA5TAATACGACTCACTATAGGGTCCTGAACTCCTACTGGGGTTTTAGAGCTAG
_:靶位點(diǎn)序列


1.2.3 gRNA有效性的驗(yàn)證

分別將Cas9蛋白(250~300 pg/nL)與gRNA (25~35 pg/nL)等體積混勻后顯微注射到單細(xì)胞期野生型Tuebingen品系斑馬魚受精卵中。每個(gè)gRNA靶點(diǎn)注射200枚斑馬魚單細(xì)胞期受精卵誊薄,每枚受精卵注射1~2 nL混合物履恩。同時(shí)留取100枚注射等量體積DEPC水的同批胚胎作為對照。取受精后小時(shí)數(shù)(hours post-fertilization, hpf) 為72~96的F0存活胚胎和對照組存活胚胎各10枚暇屋,提取各組胚胎基因組DNA似袁。以基因組DNA為模板,采用相應(yīng)鑒定引物進(jìn)行PCR反應(yīng)(表 3)咐刨,得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化回收昙衅。T7E1酶切檢測敲除效率,將發(fā)生突變的PCR產(chǎn)物送TA克隆測序定鸟,檢測每條魚體細(xì)胞主要的突變類型而涉。


表 3 rpl15 gRNA靶位點(diǎn)突變鑒定引物序列

靶位點(diǎn)引物序列(5′→3′)片段大小/bp
gRNA1上游: GCATCATGGGAGCGTACAAG266

下游: GAGATCGTAGTGGACCACCC
gRNA2上游: ATGTCAGAATCGTGGTCGGC436

下游: GAGCCCGATGAAGGGAAGAC
gRNA3上游: GCATCATGGGAGCGTACAAG266

下游: GAGATCGTAGTGGACCACCC
gRNA4上游: GCATCATGGGAGCGTACAAG266

下游: GAGATCGTAGTGGACCACCC
gRNA5上游: GCCATGGCTTCTGTTTACGGT345

下游: CCGCCGATGGTAAGGTGAAA


1.2.4 斑馬魚突變體的篩選

將有效的gRNA和Cas9蛋白混合物顯微注射入野生型(wild type, WT)斑馬魚單細(xì)胞期受精卵中,于48~72 hpf在體式顯微鏡下觀察并記錄異常表型联予。用50 mmol/L的NaOH和1 mol/L的Tris-HCL提取單個(gè)具有明顯突變表型斑馬魚胚胎的基因組啼县,用相應(yīng)鑒定引物進(jìn)行PCR反應(yīng)材原。擴(kuò)增產(chǎn)物送測序確認(rèn)體細(xì)胞突變類型。


1.3 rpl15突變體表型的驗(yàn)證

1.3.1 O-dianisidine染色檢測斑馬魚體內(nèi)血紅蛋白表達(dá)

收取48 hpf和72 hpf的野生型及rpl15突變型幼魚各10尾季眷,采用斑馬魚血紅蛋白O-dianisidine染色試劑盒進(jìn)行檢測余蟹,具體方法參考試劑盒說明書。


1.3.2 斑馬魚中性粒細(xì)胞染色檢測斑馬魚體內(nèi)中性粒細(xì)胞生成情況

收取72 hpf的野生型及rpl15突變型幼魚各10尾子刮,采用斑馬魚中性粒細(xì)胞染色試劑盒進(jìn)行檢測威酒,具體方法參考試劑盒說明書。


1.3.3 qRT-PCR檢測rpl15突變體基因表達(dá)

收集72 hpf的野生型和rpl15突變型幼魚各10尾挺峡,分別提取總RNA并逆轉(zhuǎn)錄成cDNA葵孤。針對斑馬魚原始造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子scl、定向造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子c-myb橱赠、髓系轉(zhuǎn)錄因子pu. 1尤仍、紅系轉(zhuǎn)錄因子gata 1、中性粒細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子mpo狭姨、巨噬/單核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子l-plastin宰啦、淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子rag 1、α-globin送挑、熱休克蛋白70(heat shock protein 70绑莺,hsp 70)暖眼、抑癌基因p53和雙微染色體2基因(murine double mimute 2惕耕,mdm 2)及內(nèi)參基因gapdh設(shè)計(jì)qRT-PCR引物(表 4)。


表 4 qRT-PCR引物序列

待測基因引物序列(5′→3′)片段大小/bp
p53上游: CCCGGATGGAGATAACTTG151

下游: CACAGTTGTCCATTCAGCAC
scl上游: CTATTAACCGTGGTTTTGCTGG145

下游: CCATCGTTGATTTCAACCTCAT
c-myb上游: GCCCCCAGTATTGCTCACTT96

下游: GCATCGGGCACAGTTTGTTT
pu.1上游: AGAGCTACAAAGCGTGCAGT85

下游: CCTGGGTCCATGAAATGGCT
mpo上游: GTTTAGCAAGGGTGCGCAAA394

下游: CCTTTTGGCTGAGAAACGGC
l-plastin上游: GAAGCTCTGATCGCTCTGCT129

下游: GTTGTTGATTTTGGGGCATC
rag1上游: GTATGGGAGACGTCAGCGAG237

下游: CTGCTACCACAGGTCCCAAG
α-globin上游: TGCTCTCTCCAGGATGTTG160

下游: TCCGGCATTAAGGTCATC
mdm2上游: AAGCAGTGATCCTGAGAGTTC157

下游: ATCCGAAGACTCGCTGTTC
gata1上游: GTCCAGTTCGCCAAGTTTAC97

下游: GGGTTGTAGGGAGAGTTTAG
hsp70上游: ACCTCTTCAGGGGAACACTA78

下游: TGTCGTGGATCTGAGCCTTG
gapdh上游: AGGCAGAAGGCGGCAAAC124

下游: AAGACACCAGTAGACTCCACAAC


1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

各實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)3次诫肠,使用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行單因素方差分析司澎。檢驗(yàn)水準(zhǔn):α=0.05。


2 結(jié)果

2.1 成功制備gRNA

瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示栋豫,成功轉(zhuǎn)錄出gRNA1挤安、gRNA2、gRNA3丧鸯、gRNA4及gRNA5(圖 1)蛤铜。超微量分光光度計(jì)測定gRNA1、gRNA2丛肢、gRNA3围肥、gRNA4及gRNA5濃度分別為85、101蜂怎、50穆刻、83及76 ng/μL。


圖1 體外轉(zhuǎn)錄合成gRNA

M: DNA標(biāo)準(zhǔn)(DL600)杠步;1: rpl15-gRNA1氢伟;2:rpl15-gRNA2榜轿;3:rpl15-gRNA3;4:rpl15 -gRNA4朵锣;5:rpl15 -gRNA


2.2 分析rpl15 -gRNA5有效性

將gRNA1谬盐、gRNA2、gRNA3诚些、gRNA4及gRNA5與Cas9蛋白混合物顯微注射到斑馬魚單細(xì)胞期受精卵设褐,提取72 hpf胚胎(10枚/組)基因組,并進(jìn)行鑒定DNA片段的擴(kuò)增泣刹。T7E1酶切純化后的PCR產(chǎn)物助析,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示僅有g(shù)RNA5有效(圖 2A)。同時(shí)PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示在rpl15 -gRNA5靶位點(diǎn)(黑色框所標(biāo)注序列)附近出現(xiàn)重疊峰(圖 2B)椅您,確定rpl15 -gRNA5可有效誘導(dǎo)靶位點(diǎn)發(fā)生突變外冀。采用gRNA5和Cas9蛋白混合物批量顯微注射斑馬魚單細(xì)胞期受精卵,孵育3~5 d收集胚胎提取DNA并利用gRNA5靶位點(diǎn)鑒定引物進(jìn)行PCR掀泳,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行TA克隆測序雪隧,篩選出有移碼突變的F0代斑馬魚并檢測體細(xì)胞主要的突變類型,顯示靶位點(diǎn)附近有插入员舵、缺失及單個(gè)堿基突變(圖 2C)脑沿。


圖 2 測序及T7E1酶切檢測gRNA5的作用

A: T7E1酶切鑒定gRNA5靶位點(diǎn)發(fā)生突變M: DNA標(biāo)準(zhǔn)(DL 600);1:野生型斑馬魚組马僻;2: gRNA5/Cas9蛋白混合物注射組庄拇;B: PCR產(chǎn)物測序峰圖WT: 野生型斑馬魚組;MU(MIX) : gRNA5/Cas9混合物注射組韭邓;黑色方框標(biāo)記gRNA5靶位點(diǎn)序列措近;黑色線標(biāo)記基因組序列開始突變的位置;C: 代表性體細(xì)胞突變類型下劃線表示靶位點(diǎn)序列女淑;綠色表示PAM序列瞭郑;黃色表示單個(gè)突變后的堿基;藍(lán)色表示插入堿基鸭你;紅色虛線表示缺失堿基


2.3 篩選出rpl15突變體

顯微注射rpl15 -gRNA5和Cas9蛋白混合物到斑馬魚單細(xì)胞期受精卵屈张,提取具有明顯異常表型斑馬魚胚胎的基因組并進(jìn)行PCR,擴(kuò)增產(chǎn)物送測序袱巨。結(jié)果顯示具有明顯異常表型的斑馬魚胚胎均為rpl15基因突變體阁谆,其中包括MU1突變體(圖 3A)。通過比對氨基酸序列及移碼突變在Rpl15蛋白的位置(圖 3B)瓣窄,確定MU1突變屬移碼突變笛厦,且突變體只翻譯了120個(gè)氨基酸,破壞了Rpl15的功能域俺夕。以上結(jié)果表明通過顯微注射rpl15-gRNA5和Cas9蛋白混合物可成功篩選得到rpl15基因突變體裳凸。因此贱鄙,后續(xù)將選擇具有明顯突變表型的斑馬魚胚胎進(jìn)行相關(guān)實(shí)驗(yàn)。


圖 3 斑馬魚rpl15突變體的鑒定

A:gRNA5作用靶位點(diǎn)測序結(jié)果WT:野生型斑馬魚姨谷;MU1:rpl15突變體逗宁;黑色方框標(biāo)記靶位點(diǎn)序列;B:rpl15突變型氨基酸序列及其所在蛋白質(zhì)序列位置WT:野生型斑馬魚序列梦湘;MU1:rpl15突變體序列瞎颗;紅色方框表示第1個(gè)產(chǎn)生移碼突變的氨基酸是第119位氨基酸;121位氨基酸(終止密碼子)表示突變體翻譯到這個(gè)位點(diǎn)終止捌议,藍(lán)色實(shí)線表示移碼突變發(fā)生在Rpl15蛋白功能結(jié)構(gòu)域中


2.4 rpl15突變體的表型變化

通過對比觀察野生型和突變型斑馬魚的發(fā)育形態(tài)發(fā)現(xiàn)哼拔,突變型斑馬魚胚胎,在受精后有明顯的發(fā)育延遲瓣颅,達(dá)到相同的發(fā)育時(shí)期較野生型斑馬魚晚3~4 h倦逐。突變型斑馬魚胚胎于48、72宫补、96 hpf均表現(xiàn)出明顯的形態(tài)異常檬姥,具體包括體長縮短、向腹側(cè)彎曲的尾巴粉怕、頭部和眼睛較小及心包水腫(圖 4A)健民。約95%的突變型斑馬魚于7~10 d發(fā)生死亡(圖 4B)。


圖 4 rpl15突變對斑馬魚表型影響(×40)

A:rpl15突變型胚胎48贫贝、72及96 hpf表型黑色箭頭示“心包水腫”改變部位秉犹;紅色箭頭示尾部彎曲部位;e:眼睛部位平酿;B:突變型胚胎生存曲線凤优;C:72 hpf時(shí)突變型和野生型斑馬魚血紅蛋白染色結(jié)果統(tǒng)計(jì)數(shù)值表示不同血紅蛋白減少程度的胚胎數(shù)量悦陋,與野生型比較O-dianisidine染色陽性結(jié)果程度分為正常(黑色)蜈彼、中度減少(灰色)和重度減少(白色)3個(gè)水平,野生型組斑馬魚O-dianisidine染色均呈正常陽性結(jié)果俺驶;D:48 hpf和72 hpf突變型及野生型斑馬魚血紅蛋白O-dianisidine染色結(jié)果黑色箭頭示染色結(jié)果區(qū)域


48 hpf和72 hpf斑馬魚血紅蛋白O-dianisidine染色顯示幸逆,突變型斑馬魚較野生型斑馬魚的血紅蛋白染色陽性情況明顯減少(圖 4CD)暮现。


2.5 rpl15突變體造血相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的變化

血紅蛋白染色發(fā)現(xiàn)rpl15敲除后斑馬魚存在血紅蛋白合成減少的現(xiàn)象还绘,通過比較rpl15敲除前后scl、c-myb栖袋、pu. 1拍顷、gata1、mpo塘幅、l-plastin昔案、rag1和α-globin的mRNA水平的表達(dá)變化尿贫,進(jìn)一步驗(yàn)證斑馬魚rpl15突變體對紅系造血發(fā)育的影響是否具有特異性。結(jié)果顯示踏揣,突變型胚胎的gata 1和α-globin的表達(dá)水平較野生型胚胎顯著下調(diào)(P < 0.05庆亡,P < 0.01);突變型胚胎的scl捞稿、c-myb又谋、pu. 1、mpo娱局、l-plastin和rag 1的表達(dá)水平較野生型胚胎差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05彰亥,圖 5A)。斑馬魚中性粒細(xì)胞染色結(jié)果顯示衰齐,rpl15突變型胚胎與野生型胚胎染色結(jié)果無明顯差異(圖 5B)剩愧。表明rpl15突變體對斑馬魚紅系造血發(fā)育的損害具有特異性。


圖 5 rpl15突變體對斑馬魚造血發(fā)育的影響(×40)

A:造血相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的mRNA水平變化WT:72 hpf的野生型魚娇斩;MUT:72 hpf的rpl15突變型斑馬魚仁卷;a:P < 0.05, b:P < 0.01,與野生型比較犬第;B:斑馬魚中性粒細(xì)胞染色結(jié)果黑色箭頭示染色結(jié)果陽性區(qū)域


2.6 rpl15突變體紅系發(fā)育相關(guān)分子通路的變化

通過比較rpl15敲除前后gata 1分子伴侶hsp70锦积、p53和mdm2的mRNA水平的表達(dá)變化,來分析rpl15突變損害斑馬魚紅系發(fā)育的相關(guān)調(diào)控機(jī)制歉嗓。結(jié)果顯示丰介,突變型胚胎的p53和mdm2的表達(dá)水平較野生型胚胎顯著增加(P < 0.01,P < 0.05)鉴分;hsp 70表達(dá)顯著下調(diào)(P < 0.05哮幢,圖 6)。初步表明p53相關(guān)通路及gata1分子伴侶hsp70可能參與了rpl15缺失對斑馬魚紅系造血影響的調(diào)控志珍。


圖 6 Real-time PCR檢測rpl15突變胚胎p53橙垢、mdm2、hsp70的mRNA表達(dá)水平

WT: 72 hpf的野生型斑馬魚伦糯;MUT:72 hpf的rpl15突變型斑馬魚柜某;a: P < 0.01, b: P < 0.05,與野生型比較


3 討論

人的RPL15基因突變已在先天性純紅細(xì)胞再生障礙性貧血患者中被發(fā)現(xiàn)敛纲。迄今為止幾乎所有驅(qū)動(dòng)DBA遺傳病變的基因均在核糖體蛋白基因家族中被發(fā)現(xiàn)喂击。因此,DBA被認(rèn)為是一種核糖體疾病淤翔。近些年翰绊,與DBA疾病相關(guān)的核糖體蛋白突變研究在小鼠上陸續(xù)開展。目前,利用Cre/loxP系統(tǒng)策略成功構(gòu)建了條件性敲除Rps19监嗜、Rpl11基因的轉(zhuǎn)基因小鼠模型琳要,表現(xiàn)出與DBA患者相似的生長遲緩和貧血的表型[8]。然而秤茅,構(gòu)建轉(zhuǎn)基因小鼠模型存在實(shí)驗(yàn)周期長稚补、成本高和不適用于對潛在治療藥物進(jìn)行高通量篩選的缺點(diǎn)。與小鼠相比框喳,斑馬魚則憑借胚胎透明课幕、易于觀察、產(chǎn)卵量大和發(fā)育快的優(yōu)勢五垮,使其成為觀察早期造血發(fā)育和用于大規(guī)模篩選潛在治療藥物的理想模型乍惊。目前,利用嗎啉環(huán)修飾的反義寡核苷酸(morpholino放仗,MO)技術(shù)下調(diào)rps19润绎、rpl5、rpl35A诞挨、rps24和rps7基因均較好地重現(xiàn)了DBA表型[9-11]莉撇。同時(shí)利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)也成功構(gòu)建了rpl11、rps9和rps29基因突變的DBA疾病相關(guān)斑馬魚模型[12-14]惶傻。鑒于rpl15在DBA疾病發(fā)生發(fā)展中的機(jī)制研究仍不明確棍郎,且在斑馬魚上rpl15敲除模型的建立仍有空缺,因此本課題致力于研究rpl15對斑馬魚造血的影響银室,從而進(jìn)一步探究其在DBA發(fā)生發(fā)展中的機(jī)制作用涂佃。


本研究利用CRISPR/Cas9定向基因編輯技術(shù)敲除斑馬魚rpl15基因,共設(shè)計(jì)了5條gRNA蜈敢,分別與Cas9蛋白共注射到單細(xì)胞期斑馬魚受精卵中辜荠。結(jié)果顯示,gRNA5對rpl15具有高效的編輯作用抓狭。通過批量顯微注射gRNA5/Cas9蛋白混合物到單細(xì)胞期斑馬魚受精卵中伯病,成功篩選獲得rpl15突變體。其中包括MU1突變型個(gè)體辐宾,該個(gè)體產(chǎn)生了移碼突變且提前終止翻譯狱从,從而破壞了Rpl15的功能域。研究表明叠纹,已建立的DBA疾病相關(guān)斑馬魚模型具有頭部發(fā)育不全、尾巴彎曲敞葛、體長縮短誉察、心包水腫和體內(nèi)血紅蛋白合成減少等表型。與之前結(jié)果相一致惹谐,本研究在rpl15突變體也觀察到了相同的表型持偏,而且rpl15突變體表現(xiàn)出了更為嚴(yán)重的心包水腫現(xiàn)象驼卖。這與研究報(bào)道的人RPL15基因突變的DBA患者出現(xiàn)非常嚴(yán)重的早期胎兒水腫癥狀一致[15]。此外本研究證實(shí)rpl15突變體原始造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子scl鸿秆、定向造血干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子c-myb酌畜、髓系轉(zhuǎn)錄因子pu. 1、中性粒細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子mpo卿叽、巨噬/單核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子l-plastin及淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子rag 1的mRNA表達(dá)水平與對照組相比無明顯差異桥胞,同時(shí)中性粒細(xì)胞染色也證實(shí)rpl15突變型胚胎與野生型胚胎的中性粒細(xì)胞生成情況無明顯差異,但紅系轉(zhuǎn)錄因子gata 1和α-globin的mRNA表達(dá)水平與對照組相比均顯著下調(diào)考婴,提示rpl15突變體特異性的損害了斑馬魚紅系造血發(fā)育贩虾。這些結(jié)果表明,利用CRISPR/Cas9技術(shù)編輯斑馬魚rpl15構(gòu)建DBA疾病相關(guān)斑馬魚模型具有重要意義沥阱。


斑馬魚DBA疾病相關(guān)模型研究報(bào)道證實(shí)缎罢,核糖體突變體胚胎形態(tài)發(fā)育異常及貧血表型的形成與p 53通路密切相關(guān)。大量研究證實(shí)在斑馬魚DBA疾病相關(guān)模型中下調(diào)p53均可一定程度挽救突變體形態(tài)發(fā)育上的缺陷考杉。同時(shí)研究發(fā)現(xiàn)抑制p53的表達(dá)可以部分挽救rpl18策精、rpl11和rps9等突變體中紅系造血發(fā)育的缺陷[1316]。本研究結(jié)果顯示崇棠,rpl15突變體p53和mdm2基因的mRNA水平顯著增高蛮寂。當(dāng)rpl15發(fā)生突變時(shí),會(huì)導(dǎo)致游離核糖體蛋白在核仁內(nèi)累積易茬,從而與mdm2發(fā)生結(jié)合[17]酬蹋。在與上述游離核糖體蛋白結(jié)合后,Mdm2泛素連接酶的活性受到抑制抽莱,而這會(huì)激活p53的表達(dá)范抓,從而導(dǎo)致相應(yīng)細(xì)胞周期停滯和凋亡的發(fā)生[18]。表明p53通路可能在斑馬魚rpl15突變體表型的形成中發(fā)揮重要作用食铐。此外研究表明匕垫,紅系分化過程中HSP70可從細(xì)胞質(zhì)遷移到細(xì)胞核,以保護(hù)GATA1免受caspase-3介導(dǎo)的分裂虐呻,從而正常調(diào)控紅系分化發(fā)育[19-20]象泵。本研究結(jié)果顯示,rpl15突變體的gata1斟叼、hsp70的mRNA水平顯著下調(diào)偶惠。hsp70轉(zhuǎn)錄水平的下調(diào)可能將導(dǎo)致Gata1受到caspase-3的裂解,從而致使rpl15突變體的紅系造血發(fā)育受損朗涩。


綜上所述忽孽,本研究發(fā)現(xiàn)通過CRISPR/Cas9技術(shù)編輯斑馬魚rpl15基因,可以獲得具有形態(tài)發(fā)育異常并伴有貧血表型的突變體。初步認(rèn)為p 53通路和hsp70可能參與調(diào)控rpl15突變體表型的形成兄一,有助于進(jìn)一步探究rpl15在相關(guān)疾病發(fā)生厘线、發(fā)展中的作用。


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